La trama se centra en una Guerra del Santo Grial copiada erróneamente de la Tercera Guerra del Santo Grial en Fuyuki. Después del final de la Tercera Guerra, una organización de los Estados Unidos que tiene magos operando separados de la Asociación de Magos con sede en Londres, puesto que los miembros obtuvieron información durante la Guerra del Santo Grial de Fuyuki y planearon su propio ritual.
Después de setenta años, ellos usaron la ciudad de Snowfield como la Tierra Sagrada para su propia Guerra del Santo Grial, pero no pudieron copiar con éxito todos los detalles, lo que condujo a que fuera una imitación poco fiable que perdió a la clase Saber y permitió la invocación de extraños Servants debido a una definición de “héroe” alterada.
10 años antes de lo eventos de Fate/Stay Night, toma lugar la cuarta Guerra del Santo Grial, Emiya Kiritsugo, aliado con la familia Einzbern, recibe la funda de la espada sagrada e invoca al servant Saber, decidido a eliminar a sus enemigos y alcanzar el Grial.
Juden-chan es el nombre de un grupo de chicas especiales que provienen de una dimensión alterna que usan electricidad para reanimar a gente deprimida. Plug, la protagonista, posee un dispositivo el cual le indica el nivel de depresión ('A' siendo el peor grado, y 'F' siendo lo contrario). Ya que ella es de otra dimensión, posee tecnología que le permite volar, pasar a travez de objetos, y hacer que aparezcan enormes conectores eléctricos como por arte de magia. Plug siempre trata de dar su mejor esfuerzo, pero es algunas veces un tanto incompetente. Esto se hace evidente cuando por accidente conoce a Sentou, un chico que no solo la puede ver, si no también tocar (o mas bien golpear con un bate de béisbol). Desafortunadamente para Plug, la hermana de sentou es su blanco actual y tendrá que sobrepasar el obstáculo de un hermano sobre protector para poder recargar la energía vital que ella ha perdido.
Fight League... la batalla definitiva a la que aspiran todos los luchadores. Varias marcas se enfrentan en duras batallas preliminares con la intención de conseguir un puesto para participar en la Fight League. Entre esas marcas está GGG, quienes celebran la Copa GGG y en la cual los luchadores usan sus gadgets para intentar llegar a lo más alto. La clave de la victoria son las art chains, habilidades cooperativas entre compañeros. G-Wrench es una joven que sueña con llegar a al Fight League y porta un enorme gadget mientras intenta liderar a su equipo, Boltechs, para alcanzar su meta
Años después de la lucha contra Sephiroth, una terrible enfermedad llamada Geostigma ha aparecido afectando a Denzel (un huerfano acogido por Tifa) y al propio Cloud. Mientras tanto, en el cráter del Norte unas misteriosas sombras han aparecido amenazando de nuevo al planeta. Cloud toma su espada de nuevo y lucha por conseguir el perdón que ansía.
Naota Nandaba es un joven que vive una vida completamente normal y aburrida, todos los días se reúne con Mamimi Samejima la ex-novia de su hermano Tasuku quien se fue a Estados Unidos para jugar Baseball. Pero todo esto cambia una vez Haruko Haruhara entra en su vida y la normalidad y aburrimiento es sustituida por extraños eventos que involucran a su familia, amistades y su ciudad además de los constantes ataques por parte de robots que salen de su cabeza.
Cocona es una estudiante modelo, aunque demasiado cauta y reacia a aprovechar nuevas oportunidades. Esto hace que la aparición de una misteriosa chica llamada Papika le complique la vida cuando ambas acaban en una especie de mundo desconocido y con la misteriosa chica buscando un cristal en concreto. Sin embargo, la situación acabará despertando algo en el interior de Cocona, que podrá transformarse en un ser similar a una hada y con ello viajar por el mundo de "Pure Illusion".
La historia cómica está protagonizada por Makoto Kowata, una bruja de 15 años, y el resto de chicos y chicas de su vida diaria. Junto a su gato negro Chito, la chica se muda de Yokohama a Aomori para vivir con un primo en la zona norte de Japón.
La historia está protagonizada por Hasekura Kouhei, un chico que lleva más institutos que años de vida y esta vez se traslada a uno situado en una pequeña isla de ésas que poblan el archipiélago japonés. Lo que no sabe es que algunos de los estudiantes que allí se encuentran son vampiros.
La historia tendrá lugar en una isla, donde el Sistema Fractal ha empezado a colapsar. Un día, Crane encuentra en un precipicio a una chica herida, llamada Phyrne. Ella desaparece dejando un pendiente. Crane y el avatar con forma de niña, Nessa, inician un viaje para Phyrne y descubren el secreto del Sistema Fractal.
¿Qué harías si pudieras detener el tiempo? Moritani, por ejemplo, está usando su habilidad inusual para detener el tiempo durante tres minutos al día para observar a las personas que la rodean. Un día, ella elige “observar” las bragas de la idol de clase, Murakami, solo para encontrarse en una situación muy comprometedora cuando su compañera de clase resulta ser inmune a su poder.
La historia da comienzo cuando Ao abre un paquete que llega a su casa y en el cual se encuentra Gourai, una Frame Arms Girl, un pequeño robot con movimiento independiente. Gourai es un nuevo prototipo, una Frame Arms Girl con una IA avanzada llamada “Artificial Self” y que le otorga personalidad. Ao es la única que logra activarla y Gourai comienza a recopilar datos de combate y de emociones, viviendo día a día con Ao, quien no tiene experiencia ninguna con estos pequeños robots.
Francesca es una “idol no-muerta” que vaga por las calles de Sapporo y canta sobre la comida, los puntos de interés de Hokkaido. Siempre va acompañada de su fiel perro Franken y no hay día en el que no tenga que huir de un exorcista que siempre la persigue.
La historia gira en torno a Haruka Nanase, un muchacho al que siempre le ha gustado estár en el agua y nadar. Antes de graduarse de la escuela primaria, participó en un torneo de natación junto a sus compañeros del club de natación: Makoto Tachibana, Nagisa Hazuki y Rin Matsuoka. Tras conseguir la victoria, cada uno de los chicos siguió su propio camino. El tiempo ha pasado, y en mitad del instituto, Rin aparece y reta a Haruka a una carrera, demostrando a este lo bueno que es. Haruka no quiere que eso acabe así, así que reúne de nuevo a Makoto y a Nagisa, así como a un nuevo miembro llamado Rei Ryugazaki, para formar el club de natación del Instituto Iwatobi. Haruka, Makoto Nagisa, Rei y Rin vivirán juntos una historia de natación, juventud y amistad.
Vuelven los miembros del club de natación del instituto Iwatobi, donde Haru, Makoto, Nagisa y Rei son ahora más amigos que nunca. Con cada día que pasa, los chicos crecen más y más, y Rin intenta superar su pasado con ayuda de sus nuevos compañeros. Ahora tendrán que enfrentarse a un nuevo verano.
¡Zambúllete en el futuro! Haruka y sus compañeros se graduaron de la preparatoria y han comenzado a dar sus primeros pasos en dirección a sus futuros deseados, aunque todos guardan con cariño en sus corazones los vínculos que forjaron nadando juntos. En Tokio Haruka se reúne con Asahi, con quien en su día nadó en relevos. Es entonces cuando los recuerdos de secundaria vuelven a Haruka, y el aspecto que tenía Ikuya en aquel entonces revive en su corazón. Makoto, que se ha mudado a Tokio con Haruka, comienza a avanzar hacia su nuevo sueño. Rin, ahora en Sydney, vive un encuentro inesperado.
En el 2041 la humanidad fundó su primera colonia espacial en la Luna. Pero tras el terrible cataclismo que acabó con la civilización en la Tierra, la humanidad en la República Lunar ha levantado la megalópolis de Edén. Es el año 2267, un chico llamado Takeru pasa el tiempo participando en carreras contra bandas callejeras rivales, ignorando que está a punto de embarcarse en un viaje para descubrir el origen de Edén.
La Tierra es invadida por seres extra-dimensionales, conocidos como “Los Nova”. Kazuya perdió a su hermana en la guerra que se desató contra estos seres, y decide enrolarse en Genetics, una academia militar donde se entrena a las guerreras conocidas como Pandoras, quienes, mediante la implantación en sus cuerpos de un tejido conocido como Stigmata, adquieren las habilidades necesarias para combatir a los invasores. Pero, no pueden combatir solas, necesitan una pareja, un chico joven llamado Limiter, que evite el efecto de “Freezing” (Congelamiento, del espacio-tiempo en este caso) que es lo que sucede siempre que los Nova aparecen. Kazuya terminará siendo el compañero de Bridget L. Satellizer, conocida como “La Reina Intocable”, ya que por su ferocidad y carácter insoportable, es la única Pandora que jamás ha sido capaz de tener una pareja estable. Juntos, se ayudarán mutuamente para tratar de sanar las heridas del pasado.
La Tierra es invadida por seres extra-dimensionales, conocidos como “Los Nova”. Kazuya perdió a su hermana en la guerra que se desató contra estos seres, y decide enrolarse en Genetics, una academia militar donde se entrena a las guerreras conocidas como Pandoras, quienes, mediante la implantación en sus cuerpos de un tejido conocido como Stigmata, adquieren las habilidades necesarias para combatir a los invasores. Pero, no pueden combatir solas, necesitan una pareja, un chico joven llamado Limitador, que evite el efecto de “Freezing” (Congelamiento, del espacio-tiempo en este caso) que es lo que sucede siempre que los Nova aparecen. Kazuya terminará siendo el compañero de Satellizer L. Bridget, conocida como “La Reina Intocable”, ya que por su ferocidad y carácter insoportable, es la única Pandora que jamás ha sido capaz de tener una pareja estable. Juntos, se ayudarán mutuamente para tratar de sanar las heridas del pasado.
Honda Toru es una estudiante que después de la muerte de su madre decide vivir sola en una tienda de campaña en el bosque, propiedad de la familia Soma. Una noche es encontrada por Yuki Soma, el "príncipe" de su escuela, este y su primo Shigure le piden que viva con ellos. Dentro de la casa conoce a Kyo, otro integrante de la familia Soma y la terrible maldición que pesa sobre ellos que consiste que al ser abrazados por el sexo opuesto se transforman en animales del zodiaco chino (a excepción de Kyo que es el gato).
La historia está protagonizada por Tohru Honda, una joven estudiante que por cuestiones de la vida y su mala suerte, acaba teniendo que vivir en una tienda de campaña en un terreno que pertenece al misterioso clan de los Soma, quienes no tardan en descubrir su secreto. Lo que Tohru no esperaba era que los Soma la acogieran y que estos tenían su propio secreto: cuando alguien del sexo opuesto los toca, se convierten en animales del zodiaco chino.
La historia titulada Kyо̄ko to Katsuya no Monogatari, centrada en los padres de Tohru Honda, Kyо̄ko y Tatsuya, que no se adaptaron en el anime. Y por otra, nuevas escenas que se sitúan tras el desenlace de la serie y que han sido creadas específicamente por la autora.
La historia es una comedia protagonizada por Sakaguchi, un muchacho de instituto que es un “fudanshi“, lo que viene siendo una versión masculina de una fujoshi al amar profundamente las historias de boys-love.
En Fukigen na Mononokean su protagonista, Ashiya, ha pasado los primeros siete días de escuela atrapados en la enfermería debido a un yōkai que no se despega de él. Éste termina pidiendo al propietario de una pequeña sala de té llamado “Mononokean” ayuda para librarse del yōkai. El dueño taciturno de Mononokean intentará guiar al yōkai a pasear al otro mundo.
El anime cuenta una historia romántica cuya temática es “música y amor no correspondido”. Nino, una chica a la que le encanta cantar, hizo una promesa con su primer amor, Momo, y Yuzu, que componía canciones, de que algún día encontrarían su voz y se dedicarían al mundo de la canción. Los tres se separaron, pero Nino mantuvo su promesa y siguió cantando. Años después, los tres son ya estudiantes de instituto, y Nino se ve muy atraída por el mundo de los clubes musicales.
Tras perder a su madre, Alphonse y Edward Elric tratan de revivirla usando la ciencia prohibida de la alquimia humana. Sin embargo, la alquimia opera bajo la teoría del cambio equivalente y romper el tabú de la alquimia humana acarrea un alto precio. Ed pierde una de sus piernas y Al su cuerpo. Ed logra sellar el alma de Al dentro de una gran armadura, a costa de su brazo. Años después, Ed (ahora con dos extremidades mecánicas) y Al (aún atrapado en la armadura) dejan su casa de la niñez, cada uno preocupado por la felicidad del otro. Ed, quien tuvo un talento y habilidad natural para la alquimia, se convierte en un alquimista con certificado nacional y pronto es conocido en todas partes como el “Alquimista Fullmetal”. El verdadero objetivo de ambos hermanos es buscar cualquier información sobre la legendaria Piedra Filosofal, con la esperanza de que ésta les permita recobrar sus cuerpos. Todas sus esperanzas descansan en la mítica piedra, que incluso puede no existir.
Sosuke Sagara es un soldado del elite que pertenece a una fuerza especial independiente denominada "Mithril". Sagara, un Segundo Teniente bajo la orden de Mithril, es asignado al deber de proteger a una chica Kaname Chidori, que asiste la preparatoria en Japon. Para alcanzar esta tarea, el finge ser un estudiante de transferencia que asiste en la escuela de Kaname.
The Second Raid (TSR) es la secuela del primer Full Metal Panic y continúa la historia desde el final de la anterior. Basado en la novela de Full Metal Panic la versión anime entra en más detalles íntimos de Sousuke y Kaname, y por supuesto, de acción. La serie comienza dos meses después de los eventos ocurridos en el Tuatha de Danaan al final de la serie original (Full Metal Panic). Mithril toma conciencia de una organización secreta que tiene en sus manos tecnología capaz de contener el modo ECS (Electronic Cloaking System).
Esta segunda entrega de Full Metal Panic! sigue con rigor el manga. Full Metal Panic? Fumoffu consiste en episodios cortos, que tiene lugar en su mayor parte en la escuela, con una ambientación más en la línea de la comedia. La escuela se supone que es un lugar de esstudio. Ya no... porque esta misma mañana, Sagara hizo añicos la caja de zapatos de Kaname después de sospechar que alguien la había estado manipulando, cuando en realidad lo que habían hecho era introducir en ella una carta de amor...
Full Metal Panic! sigue las andanzas de Sousuke Sagara, un miembro de una organización anti-terrorista privada conocida como Mithril, al que se le encarga la tarea de proteger a Kaname Chidori, una estudiante de instituto japonesa con una personalidad bastante difícil.
Mitsuki es una chica que tiene 12 años. Vive con su abuela y padece de un tumor maligno en su laringe. Cuando era pequeña, hizo una promesa con el chico que más le gustaba (Eichi) y se dijeron que ella seria una cantante y él un astrónomo. Ellos dos fueron separados; Eichi se fue a América y así Mitsuki quiere hacerse famosa para que Eichi la vea y así se puedan reunir de nuevo. Mitsuki se entera de un cásting que hacen en su ciudad en busca de una estrella juvenil, pero a causa de su enfermedad, su abuela no la deja cantar ya que esto sólo la empeoraría. Mientras estaba en casa se le aparecen dos guardianes de la muerte (Shinigamis), llamados Meroko y Takuto, ellos han venido con la misión evitar cualquier circunstancia que pudiera hacerla morir antes de tiempo. Por alguna extraña razón, ella los puede ver y aunado a esto, se les escapa que dentro de un año morirá a causa de su enfermedad, así que Mitsuki decide escaparse de casa para
